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Issue
Genet. Sel. Evol.
Volume 32, Number 4, July-August 2000
Page(s) 441 - 457
DOI https://doi.org/10.1051/gse:2000130
DOI: 10.1051/gse:2000130

Genet. Sel. Evol. 32 (2000) 441-457

Cytogenetical anchoring of sheep linkage map and syntenic groups using a sheep BAC library

Kamila Tabet-Aoula,b - Anne Oustry-Vaimanb - Daniel Vaimanb - Nadhira Saïdi-Mehtarc - Edmond-Paul Cribiub - Frédéric Lantiera

aLaboratoire de pathologie infectieuse et immunologie, Institut national de la recherche agronomique, 37380 Nouzilly, France
bLaboratoire de génétique biochimique et de cytogénétique, Département de génétique animale, Institut national de la recherche agronomique, 78352 Jouy-en-Josas Cedex, France
cLaboratoire de biologie moléculaire et génétique, Université Oran Es-Sénia, 31000 Oran, Algérie

(Received 7 September 1999; accepted 14 March 2000)

Abstract:

In order to simultaneously integrate linkage and syntenic groups to the ovine chromosomal map, a sheep bacterial artificial chromosome (BAC) library was screened with previously assigned microsatellites using a sheep-hamster hybrid panel and genetic linkage. Thirty-three BACs were obtained, fluorescently labelled and hybridised on sheep-goat hybrid metaphases ( $2{\rm n} = 57$). This study allowed us, (i), to anchor all linkage groups on sheep chromosomes, (ii), to give information on the probable position of the centromere on the linkage map for the centromeric chromosomes, (iii), to contradict the previous orientation of the ovine X linkage group by the mapping of BMS1008 on OARXq38. Concerning our somatic cell hybrid panel, this study resulted in the assignment of all the previously unassigned groups to ovine chromosomes and a complete characterisation of the hybrid panel. In addition, since hybridisations were performed on a sheep-goat hybrid, new marker/anchoring points were added to the caprine cytogenetic map.


Keywords: mapping / microsatellite / sheep / BAC library / FISH

Résumé:

Ancrage cytogénétique de la carte de liaison et des groupes de synténie par utilisation d'une banque de BAC ovine. Afin d'intégrer, la carte génétique et les groupes de synténies à la carte chromosomique ovine, nous avons criblé, à l'aide de microsatellites, une banque ovine de chromosomes artificiels de bactéries (BAC). Les microsatellites utilisés font partie de la carte de liaison ovine et ont été localisés précédemment dans notre panel d'hybrides somatiques hamster-mouton. Nous avons isolé 33 clones BAC, marqués en fluorescence et hybridés sur métaphase d'un hybride chèvre-mouton ( $2{\rm n} = 57$). Les résultats de cette étude ont apporté plusieurs informations. Au niveau de la carte génétique, ces localisations ont permis l'ancrage des groupes de liaison sur les chromosomes ovins et de donner la position la plus probable du centromère sur les groupes de liaison correspondant aux chromosomes métacentriques. De plus, pour le chromosome X, la localisation du microsatellite BMS1008 a permis de corriger l'orientation du groupe de liaison. Au niveau de notre panel d'hybrides somatiques hamster-mouton, ces résultats ont permis d'assigner cytogénétiquement tous les groupes de synténies à un chromosome ovin, aboutissant à une caractérisation approfondie du panel. Enfin, en utilisant des métaphases d'hybride chèvre-mouton pour les hybridations in situ, nous avons pu ajouter de nouveaux marqueurs et points d'ancrages sur la carte chromosomique caprine.


Mots clé : cartographie / microsatellite / mouton / banque BAC / FISH

Correspondence and reprints: Edmond-Paul Cribiu
e-mail: cribiu@biotec.jouy.inra.fr

Copyright INRA, EDP Sciences

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