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Genet. Sel. Evol.
Volume 32, Number 3, May-June 2000
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| Page(s) | 265 - 287 | |
| DOI | https://doi.org/10.1051/gse:2000118 | |
DOI: 10.1051/gse:2000118
Genet. Sel. Evol. 32 (2000) 265-287
Predicting observed and latent responses to BLUP selection involving logistic variates
Jean-Jacques Colleaua - Elizabeth Le Bihan-Duvalb
aStation de génétique quantitative et appliquée,
Institut national de la recherche agronomique
78352 Jouy-en-Josas Cedex, France
bStation de recherches avicoles,
Institut national de la recherche agronomique
37380 Nouzilly, France
(
Abstract:
Multivariate BLUPs can be derived when data are a mixture of continuous
traits and observed discrete traits controlled by logistic latent
traits. Algorithms were developed for predicting discrete responses
to BLUP selection, and latent responses when the selection process
included additional culling on scores. These algorithms were Taylor
expansions using well-known expressions such as the probabilities and
the two first moments of the truncated multinormal distribution, after
appropriate re-parametrizations. They were compared to very accurate
quadrature integrations. The test examples were suggested by a situation
found in chickens where selection can involve body weight and leg
deformity described by two logistic latent variates. Quadratic Taylor
expansions generally provided a good accuracy. Therefore, they could
be recommended when quadrature methods are too demanding, e.g.,
for complex breeding schemes.
Keywords:
logistic / BLUP / selection / response
Résumé:
Prédiction des réponses observées et sous-jacentes à la
sélection sur le BLUP.
On peut calculer des BLUPs à partir de données mélangeant des caractères
continus et des caractères discrets contrôlés par des variables logistiques.
On développe des algorithmes de prédiction des réponses discrètes à la
sélection sur le BLUP. De même, on cherche à prédire les réponses sur
les variables latentes quand le processus de sélection inclut une sélection
directe sur les variables discrètes en plus de la sélection sur le BLUP.
Ces algorithmes sont des développements de Taylor qui utilisent des
expressions bien connues, telles que la probabilité et les deux premiers
moments d'une distribution multinormale tronquée, après modification
appropriée des paramètres. Ils sont comparés à des quadratures numériques
très précises. Les exemples de test proviennent d'une situation rencontrée
en sélection avicole où la sélection peut impliquer le poids corporel et
les déformations des pattes, décrites par deux variables latentes logistiques.
Les développements de Taylor du second degré sont généralement précis. Par
conséquent, ils pourraient être utilisés quand les méthodes de résolution
par quadratures sont trop exigeantes en temps de calcul.
Mots clé :
logistique / BLUP / sélection / réponse
Correspondence and reprints: Jean-Jacques Colleau; ugencjj@dga2.jouy.inra.fr
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