Free Access
Issue
Genet. Sel. Evol.
Volume 32, Number 3, May-June 2000
Page(s) 311 - 320
DOI https://doi.org/10.1051/gse:2000121
DOI: 10.1051/gse:2000121

Genet. Sel. Evol. 32 (2000) 311-320

Cytogenetic mapping of 25 goat mammary gland Expressed Sequence Tags (ESTs)

Fabienne Le Provost - Laurent Schibler - Anne Oustry-Vaiman - Patrice Martin - Edmond P. Cribiu

Laboratoire de génétique biochimique et cytogénétique, Département de génétique animale, Institut national de la recherche agronomique, 78352 Jouy-en-Josas Cedex, France

(Received 16 August 1999; accepted 11 January 2000)

Abstract:

Today, there is a shift towards a positional candidate approach in the molecular identification of genes. This study reports on an Expressed Sequence Tags (ESTs) mapping initiative in goats, based on sequence information gathered from a previous mammary gland cDNA systematic sequencing project. A total of 25 novel genes was localised cytogenetically on 16 goat chromosomes. Six of these ESTs were found to map to cattle milk QTL regions. These results made it possible to assess the use of ESTs as a shortcut to the molecular identification of some QTLs and as a valuable tool for comparative mapping.


Keywords: cytogenetic localisation / mammary gland cDNA / comparative mapping / goat

Résumé:

Localisation cytogénétique de 25 ESTs caprins issus de glande mammaire. L'identification moléculaire des gènes s'oriente actuellement vers une stratégie de candidats positionnels. Cette étude, réalisée chez la chèvre, décrit la localisation cytogénétique d'étiquettes (ESTs) obtenues précédemment par séquençage d'ADNc de glande mammaire. Au total, 25 nouveaux gènes ont ainsi été localisés sur 16 chromosomes caprins. Six de ces gènes ont été cartographiés dans des régions de QTL laitiers bovins. Ces résultats ont permis d'évaluer les possibilités d'utilisation des ESTs, d'une part, pour l'identification moléculaire des QTL et d'autre part, comme outil de cartographie comparée.


Mots clé : localisation cytogénétique / ADNc de glande mammaire / carte comparée / chèvre

Correspondence and reprints: Edmond P. Cribiu; cribiu@biotec.jouy.inra.fr

Copyright INRA, EDP Sciences

Current usage metrics show cumulative count of Article Views (full-text article views including HTML views, PDF and ePub downloads, according to the available data) and Abstracts Views on Vision4Press platform.

Data correspond to usage on the plateform after 2015. The current usage metrics is available 48-96 hours after online publication and is updated daily on week days.

Initial download of the metrics may take a while.