A high-density linkage map of the RN region in pigs

Christian Looft; Denis Milan; Jin-Tae Jeon; Sven Paul; Norbert Reinsch; Claire Rogel-Gaillard; Virginie Rey; Valérie Amarger; Annie Robic; Ernst Kalm; Patrick Chardon; Leif Andersson

doi:doi:10.1051/gse:2000122

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Volume 32 / No 3 (May-June 2000)

Genet. Sel. Evol., 32 3 (2000) 321-329

Abstract

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Issue		Genet. Sel. Evol. Volume 32, Number 3, May-June 2000


Page(s)		321 - 329
DOI		https://doi.org/10.1051/gse:2000122

DOI: 10.1051/gse:2000122

Genet. Sel. Evol. 32 (2000) 321-329

A high-density linkage map of the RN region in pigs

Christian Looft^a - Denis Milan^b - Jin-Tae Jeon^c - Sven Paul^a - Norbert Reinsch^a - Claire Rogel-Gaillard^d - Virginie Rey^b - Valérie Amarger^c - Annie Robic^b - Ernst Kalm^a - Patrick Chardon^d - Leif Andersson^c

^aInstitute of Animal Breeding and Husbandry, Christian-Albrechts-University, 24098 Kiel, Germany
^bLaboratoire de génétique cellulaire, Institut national de la recherche agronomique, 31326 Castanet-Tolosan, France
^cDepartment of Animal Breeding and Genetics, Swedish University of Agricultural Sciences, 751 24 Uppsala, Sweden
^dLaboratoire de radiobiologie et d'étude du génome, Institut national de la recherche agronomique / Centre énergie atomique, 78352 Jouy-en-Josas Cedex, France

(Received 6 December 1999; accepted 10 February 2000)

Abstract:

The porcine RN locus affects muscle glycogen content and meat quality. We previously mapped the RN locus to chromosome 15. This study describes the identification of polymorphisms for four class I and four class II markers located in the RN region. Resource families were genotyped with F-SSCP markers (fluorescent single strand conformation polymorphism) and microsatellite markers. Subsequent multipoint linkage analysis revealed the order FN1-IGFBP5-S1000-S1001-IL8RB-VIL1-RN-Sw936-Sw906. The gene order is identical to the previously reported porcine RH map of the same region. The described map will facilitate positional cloning of the RN gene.

Keywords: pig / meat quality / RN gene / genetic mapping

Résumé:

Cartographie génétique de la région de RN chez le porc. Le gène RN influence le taux de glycogène musculaire et la qualité de la viande chez le porc. Il a été cartographié sur le chromosome 15. Cette étude présente la cartographie de quatre marqueurs SSCP (Polymorphisme de Conformation Simple Brin) et de quatre microsatellites situés à proximité de RN. L'analyse multipoint a permis de montrer que chez le porc l'ordre de ces marqueurs, FN1-IGFBP5-S1000-S1001-IL8RB-VIL1-RN-Sw936-Sw906, est identique à celui chez l'homme et la souris. Le positionnement de RN relativement aux marqueurs proches facilitera l'identification du gène responsable par clonage positionnel.

Mots clé : porc / qualité de la viande / gène RN / liaison génétique

Correspondence and reprints: Christian Looft; clooft@tierzucht.uni-kiel.de

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